La unificación detección de comunidades a diferentes escalas: desde el gen hasta el paisaje


Stephanie F. Hudon, Andrii Zaiats, Anna Roser, Anand Roopsind, Cristina Barber, Brecken C. Robb, Britt A. Pendleton, Meghan J. Camp, Patrick E. Clark, Merry M. Davidson, Jonas Frankel-Bricker, Marcella Fremgen-Tarantino, Jennifer Sorensen Forbey, Eric J. Hayden, Lora A. Richards, Olivia K. Rodriguez and T. Trevor Caughlin 

Palabras claves: biodiversidad, asignación latente de Dirichlet, metabolómica, metagenómica, artemisa, conservación

Resumen:
La ciencia de la biodiversidad abarca múltiples disciplinas y escalas biológicas: desde moléculas hasta paisajes. Sin embargo, los datos de biodiversidad a menudo se analizan por separado con metodologías específicas de cada disciplina, limitando las inferencias resultantes a una sola escala. Para mejorar la investigación interdisciplinaria, presentamos un marco de modelado de tópicos que analiza la composición de la comunidad mediante el uso de datos generados a partir de la metagenómica, metabolómica, ecología de campo y la teledetección. Con la utilización de modelos de tópicos, demostramos que la detección de comunidades que incluyen diferentes conjuntos de datos puede ser parte en la conservación de organismos interactuantes como lo son las plantas y herbívoros. Encontramos que los modelos de tópicos pueden identificar miembros de comunidades moleculares, de organismos y de paisajes que se relacionan con la salud de la vida silvestre: desde los microbios intestinales hasta la calidad del forraje. Concluimos que, a futuro, los modelados de tópicos pueden ser utilizados para  diseñar estudios entre escalas que promuevan un enfoque holístico para detectar, monitorear y gestionar la biodiversidad.

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